Real-time texture analysis for gastroscopic exam.

  • Swimlane: 2020-2021
  • Column: DONE
  • Position: 2
  • Assignee: Olivier Debeir
  • Creator: Olivier Debeir
  • Started: 01/10/2020 00:00
  • Created: 24/08/2020 08:49
  • Modified: 06/07/2021 13:56
  • Moved: 06/07/2021 13:56
Description

During upper digestive tract endoscopy, vision (and thus detection, diagnosis, etc.) is quite disturbed by saliva, bubbles, and other viscous liquids. Studies show that the images obtained can vary in quality and disable a correct diagnosis.

A protocol is established, which is based on an analysis of the images by an operator, using an existing scoring method to compare several clinical options (e.g. using special liquid that limits bubble formation).

The aim of the project is to provide the user with a quantitative score directly extracted from the raw images, possibly in real time, to assist the human expert.

The project will involve image processing and analysis, deep learning and embedded development.

Contacts:

Olivier DEBEIR odebeir@ulb.ac.be, Pierre EISENDRATH pierre_eisendrath@stpierre-bru.be

Sub-Tasks
Internal links
Comments
Olivier Debeir
Olivier Debeir Created at: 25/09/2020 17:51 Updated at: 25/09/2020 17:51

mi octobre Marine et léo

Olivier Debeir
Olivier Debeir Created at: 25/09/2020 17:54 Updated at: 25/09/2020 17:54

todo : préparer enquête en ligne pour scoroing d'image cf google forms

Olivier Debeir
Olivier Debeir Created at: 26/10/2020 12:52 Updated at: 26/10/2020 12:52

présentation ppt
avance bien classique,

Olivier Debeir
Olivier Debeir Created at: 03/12/2020 09:42 Updated at: 03/12/2020 10:27

présentation intermédiaire des résultats
démo St Pierre : accueil ok

proposition de développer un système embarqué rpi4 + touch + carte d'acquisition DVI... pour un feedback en RT

va contacter MD pour savoir si ok ...

Olivier Debeir
Olivier Debeir Created at: 07/12/2020 11:54 Updated at: 07/12/2020 11:54

J'ai reçu plus d'informations concernant l'acquisition des images d'examen gastroscopique à St-Pierre.
La carte d'acquisition est une Matrox VIO 7 ISA OSA sur le pc de la salle d'examen, elle prend comme entrée du SDI (non pas du DVI) depuis la tour de l'endoscope. J'ai mis en pièce jointe la doc que j'ai reçu concernant la carte.
J'ai un peu regardé et l'API du fabricant (Matrox Imaging Library) possède une licence payante. D'après la sheet l'API directshow de microsoft est aussi compatible mais elle n'est plus supportée depuis un petit temps.
Concernant la tour endoscopique il y a également un port Y/C et un port composite qui ne sont pas utilisés.
Dans le cas où on partirait sur une solution embarquée type Raspberry il existe des converters sdi to hdmi ou même sdi to usb.